继(🚻)续(xù )延(yán )(🕙)续上一季的剧情，原(🥕)来(🕐)穆(mù )(🐀)德受了骗，及时发觉错误后和史考莉(lì )(🏉)串通好来骗政(zhèng )(🚗)府高(gāo )层，以潜入(rù )一个“作为一个普通FBI特别探(tàn )员不(bú )该进入(💿)的(🎥)地方(🈺)”搜集需要的资(zī )料。本季发展越(yuè )来越精彩，一些没有被完(🔎)全(quán )改造的混血外(wài )星人联合(🚡)起来(lái )抵抗殖民阴谋。史(shǐ )考莉被绑(bǎng )架(🚻)时(🍺)子(🔪)宫(gōng )(🐂)被移除，但今年却出现了(🕺)她的孩子——艾蜜莉。今年(⏺)制作(🔮)小(👅)组甚(shèn )至找了两位知名(míng )科(kē )幻小(xiǎo )说家(👼)操(cāo )笔(🐅)，客串写出两集剧(jù )本。另外(🚓)今年也有一集喜(🍉)剧。整出(🌒)X档案(àn )为了(le )配合(🍈)电影(yǐng )的上映(🔮)，加入(rù )了一些(🍏)角色及内容，“辛迪加”组织的阴(yīn )(⛱)谋越来越(🌲)明显，穆德再一次接(🔰)近事实(🌸)的真相(xiàng )。穆德(dé )(👎)前女友的(🔚)出现(xiàn )也对穆德与史(🏫)考莉间(jiān )的关系(xì )做出重大考(📒)验。该季结束于(🌄)吸烟人烧(🆕)毁了(le )(🕠)所有X档案(àn )卷宗。