继续延续上(shàng )一(yī )季的剧情，原来(🕐)穆德受了骗，及时发觉错误后和史(shǐ )考莉串通好来骗政府(fǔ )高层，以(yǐ )潜入一(yī )个“作(👪)为一个普(🌪)通FBI特别(bié )探员(yuán )(😝)不该进(🙎)入的地方(🈺)”搜(sōu )集需(xū )要(yào )的资料(🔤)。本(💏)季(jì )发展越来越精(jīng )彩(cǎi )，一些没有被(📐)完(wán )全改造的混血(🆙)外星人联合起(🌸)来抵抗殖民阴谋。史考(😳)莉被绑(bǎng )(📤)架(🚻)时(🍺)子宫被(bèi )移(yí )除，但(🧘)今年却(❓)出现了她的(🎴)孩(hái )子—(🚩)—艾蜜(🏸)莉。今(jīn )(🈺)年制作小组(🈳)甚至找了(le )(🔍)两位知名科幻小说家操(😲)笔，客串写出(🈸)两集剧本。另外今年(🐇)也有一集喜(xǐ )剧。整(🐣)出X档案(àn )为了配(🐸)合电影的上映，加入了一些(xiē )角色及内容，“辛迪(😂)加(jiā )”组织(🐼)的(🕤)阴谋(móu )越来越明显，穆(mù )德再一(yī )次(🔂)接近事(shì )实的(de )真(🍐)相。穆德(dé )前(❗)女友(yǒu )的(🔚)出现(xiàn )也对穆德与史考莉(lì )间(🥈)的(🦀)关系做出重大考验。该季(🍆)结束于吸烟人烧(shāo )毁(😫)了所有(yǒu )X档案卷宗。