第二(èr )集中，尼奥(ào )（基努(nǔ )·里维斯(sī ) Keanu Reeves 饰(shì )(💹)）没有能从内部摧(🚗)毁“母体(🈸)”，他的(de )身体在真实(shí )世界的飞船上陷(xiàn )于昏(💯)迷，思想(🙎)却被困(kùn )在介于“母体”和真实世界的中间(👵)地带，这个地(🏃)方由“火车人”控制。墨(mò )(🆙)菲斯（劳(láo )伦(lún )斯·(📞)菲什(shí )伯(🚽)恩(ēn ) Laurence Fishburne 饰）和崔(💑)妮(nī )蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）等人知道了尼(ní )(🙅)奥(🛃)的情况，在守护天(tiān )使的带领下(🗒)， 找到了(🎆)“火车人(rén )”的控制者梅罗纹奇(🔝)，经(jīng )过一番激(jī )斗，将尼(ní )奥救了出来。此(cǐ )时(shí )(🧚)，电子乌贼(🔄)部队对锡安发起了猛烈的攻击，人(rén )类组织(🗺)所有(📑)机甲战士展(zhǎn )开顽强的抵(😜)抗，形(xíng )(👑)势危(🤼)在(💦)旦(dàn )夕；尼(🚌)奥和崔妮(nī )蒂驾(jià )驶了一艘(sōu )飞(fēi )(🎄)船克服重重困难，到达机(jī )器城市，尼奥(ào )终(📂)于(yú )见到了机器世(👄)界的统(💁)治者“机器大帝”，双方谈判(🎑)并达成了协(😞)议(yì )：尼奥(ào )除(☔)掉不(bú )受(🥟)“母体”控(🔀)制的史(shǐ )密斯，以换(huàn )取锡安的和平(píng )。在(🥚)“母(🐉)体”中(✏)，尼奥和史密斯(sī )(🍙)展(📲)开(🚽)了关系(xì )(♌)人类生(shēng )(🔙)死存亡(🤯)的最后决斗(🔐)。