21世纪初(🤸)，人类将多数(shù )(🙉)人留在被哥(🈴)斯拉(⛏)蹂躏(🤷)的地球(🔔)上，仅使(shǐ )被选中的人们(men )乘上恒星间(jiān )移(🚴)民船·阿(🕯)拉(lā )特(tè )拉姆，前(qián )往能(💹)够(gòu )移居的“约定之(zhī )地(dì )·τ星e”。但(🌹)这一计划失败，人类只得再度返回地球。而长距(jù )离亚(🤔)空间航行所(suǒ )引(📛)发的(de )时(shí )空歪曲，导致(💸)人类回到的(de )地方(fāng )变成(🔎)了“两万年(nián )后的地球”。在这个地球(🚽)，主(🍁)人公·(🕕)晴男等人(📤)在遭受(shòu )(🔪)哥斯(👚)拉袭击的同时，与埃克(kè )西弗(fú )、比尔沙尔德两(❄)种(zhǒng )族的异星人(👅)共(gòng )同实行谋(🔍)划了20年的(de )“对哥斯拉(lā )战术(🏡)”，通过殊死(sǐ )战斗(🕵)成(🎞)功击倒了哥(👆)斯拉。　(😍)　但喜(xǐ )悦并未持续多久，深藏(💼)地(🗄)下的(🀄)真(zhēn )(🎅)正哥斯(🈹)拉“哥斯拉·地球”现(xiàn )身了(🌔)。两万年(nián )间持(chí )续成长(✒)生存(cún )、身高(gāo )300米、(🍄)质量超过10万吨(♉)，在(😞)进化成这(zhè )种姿(zī )态的超(chāo )巨(jù )大(dà )哥(gē )斯拉压倒性(xìng )的破坏力面前(qián )，晴男(nán )等人落花流水。　　拯救(jiù )(🈁)了晴男的是被视(🛴)为人(rén )类的残存者“弗图亚(yà )”之民，米亚娜。弗图亚(📼)是(🛹)他们在这个(🤱)地(dì )球首(🚲)次(⬇)遇到(dào )的人型生命种(👰)族。他们会是人(⚡)类(🎷)的(👓)子(zǐ )孙吗——。“弗图亚的神也(✒)被哥斯拉(lā )击破，如(rú )今只(📈)剩下卵(😙)。挑(💝)战(zhàn )者、抗争(❎)者，全部被(bèi )火(huǒ )(🔓)焰吞噬(shì )而消(xiāo )失(🚴)了”面对这(zhè )样的他们(😾)，晴男回(🌭)应(yīng )道(📲)“这是以人类(🍯)的(de )双手夺(🤯)回地球的最后机会了”。　　另(🕦)一方面，比尔(ěr )沙尔德的指挥官(🐃)·加尔格，注意到弗图亚使(📕)用的(de )箭(🍞)头(tóu )(🚳)是由“自律(lǜ )思(sī )考(kǎo )金属体·纳米(mǐ )金(jīn )(🏺)属(shǔ )”所制造而欢喜。这和21世纪他们在(🍿)富士(shì )山麓作(🎾)为“对哥斯拉(lā )(🍨)决(🛬)战兵器”所开发、在(🍆)启(qǐ )动(🥇)前遭(zāo )到破坏(🐌)的“机械哥斯拉(🎷)”由(yóu )同(📲)种物质所构成。这正(zhèng )是当时的开发设(shè )备至今仍然残存的证(zhèng )明——(🤕)。